地球防卫同盟成立宗旨为抵抗地外文明侵略，故该组织独立于所有国家之外，拥有一套单独的行政、指挥体系，不对任何国家负责。除重大决策需各成员国投票决定外，一切大小事宜都有最高执行长官决断。

根据《科罗市协定》，除了各国指定委派的官僚、军官外，地球防卫同盟行政官员与志愿军，将由特定的考核程序，从各成员国自愿申请报名的公民中选拔。